Обновление информации о оставшемся свободном пространстве и другие баги связанные со свободным местом, которые никогда не исправят

Не могли бы вы эти факты предоставить? Предохранитель был сделан давно

Пока что это работает для всех тысяч узлов, кроме почему-то вашего. Это нужно исследовать. Если мы допустили баг здесь, его необходимо срочно исправить.
Опишите подробно, как вы добились, чтобы узел использовал диск без остатка?

Оно не задаётся, оно вычисляется: сколько осталось места в выделении (выделенное минус использованное по данным узла).
Мы рекомендуем оставлять 10% от полной вместимости, однако если вы любите риск, вы можете выделить почти всё, но я бы рекомендовал оставлять свободными хотя бы 100ГБ-200ГБ.

Аварийный уровень захардкожен на 500МБ (см. заметки о выпуске выше) и проверяется при каждой попытке загрузить кусочек на ваш узел.
Это может не сработать, если вы растащили папку storage по дискам/папкам симлинками или с помощью mount в docker.
Но для надёжности мы рекомендуем выделять место для узла на 10% меньше полной вместимости диска.