Не совпадает размер ноды и обьем занятого места на диске

Здравствуйте @dvortsov,
Проверьте, пожалуйста, ваши логи на ошибки, связанные с filewalker и базами данных:
bash:

cat /mnt/x/storagenode2/storagenode.log | grep -i error | grep -E "filewalker|database" | tail

PowerShell:

cat "C:\Program Files\Storj\Storage Node\storagenode.log" | sls error | sls "filewalker|database" | select -last 20

Если есть ошибки, то их нужно будет устранить.
С такими параметрами:

я бы посоветовал ещё включить badger cache:

pieces.file-stat-cache: badger

первый скан будет долгим, как обычно, зато последующие в несколько раз быстрее.
Следить за ними можно так:
bash

cat /mnt/x/storagenode2/storagenode.log | grep "\sused-space" | grep -E "started|completed"

PowerShell

cat "C:\Program Files\Storj\Storage Node\storagenode.log" | sls "\sused-space" | sls "started|completed"

Ещё рекомендуется удалить данные не доверенных сателлитов (нужно использовать флаг --force):