Hola,
¿Por qué decidiste que el problema está en las bases de datos y no en el subsistema de disco lento?
Puede ejecutar el comando VACUUM en cada base de datos, pero esto sólo ayudará temporalmente:
Pero si todavía crees que lo necesitas:
Otra opción es mover las bases de datos a un disco SSD:
Pero recomendaría analizar por qué el subsistema del disco puede estar lento, tal vez el disco esté fallando o esté fabricado con tecnología SMR.
Por otro lado, si está ejecutando varios nodos en el mismo pool RAID (lo que, por cierto, viola Node Operator Terms & Conditions), entonces no es sorprendente que el Los nodos son lentos. Interfieren entre sí, luchando por el mismo recurso: su pool RAID.